โครงการ Earth BioGenome ต้องการเรียงลำดับสิ่งมีชีวิตทั้งหมดบนโลก

โครงการ Earth BioGenome | กบต้นไม้อเมซอน
โครงการเอิร์ธไบโอจีโนม

มนุษย์มีนิสัยที่ไม่ดี: นับตั้งแต่สมัยพระคัมภีร์ เราได้เริ่มต้นวันสิ้นโลกเพียงเพื่อฟักแผนการในนาทีสุดท้ายเพื่อปกป้องโลกจากการถูกทำลาย

สารบัญ

  • ต้นกำเนิด
  • เหตุผล
  • ความท้าทาย
  • ไปสู่จุดจบอย่างไร

เราอาจได้รับการยกเว้นจากพระพิโรธของพระเจ้า แต่ยังไม่ถึงผลที่ตามมาจากการเปลี่ยนแปลงสภาพภูมิอากาศ ดังนั้น เมื่อระดับน้ำทะเลและอุณหภูมิโลกเพิ่มสูงขึ้น โนอาห์ยุคใหม่จำนวนหนึ่งจึงได้ทำหน้าที่รักษาชีวิตไว้ให้คนรุ่นต่อๆ ไป แทนที่จะเป็นหีบพันธสัญญา พวกเขาหันมาใช้เทคโนโลยีเป็นภาชนะในการอนุรักษ์

วิดีโอแนะนำ

“มีคำถามหลายร้อยข้อที่เราต้องถามเพื่อรู้ความลับของชีวิต”

บนเกาะห่างไกลในอาร์กติกนอร์เวย์ ห้องเก็บเมล็ดพันธุ์โลกสวาลบาร์ด เสนอโรงเก็บที่มีป้อมปราการสำหรับธนาคารเมล็ดพันธุ์อื่นๆ ประมาณ 1,700 แห่งทั่วโลก เป้าหมายขององค์กรคือการรักษาความหลากหลายทางพันธุกรรมและปกป้องภาคเกษตรกรรมจากความล้มเหลวอันเป็นหายนะอันเป็นผลมาจากสภาพแวดล้อมที่ไม่เอื้ออำนวย

ทีมสหวิทยาการที่อยู่เบื้องหลัง ชีวิตดิจิทัล, ในทางกลับกัน, ใช้กล้องความละเอียดสูงในการถ่ายภาพสัตว์ 3 มิติโดยเน้นไปที่สัตว์ใกล้สูญพันธุ์ ด้วยการเผยแพร่โมเดล 3 มิติเหล่านี้ทางออนไลน์ฟรี โครงการนี้จะช่วยแบ่งปันข้อมูลทางวิทยาศาสตร์ทั่วโลก ขณะเดียวกันก็รักษาตัวอย่างไว้ แม้จะเป็นแบบดิจิทัล เพื่อคนรุ่นต่อๆ ไป

ขณะนี้ทีมนักจีโนมได้ตั้งเป้าหมายอันทะเยอทะยานของตนเอง นั่นคือการจัดลำดับจีโนมของพืชและสัตว์ทั้งหมดบนโลก เรียกว่า โครงการเอิร์ธไบโอจีโนมพวกเขาหวังว่าจะไขความลับของวิวัฒนาการ ช่วยในการอนุรักษ์ และช่วยรักษาพิมพ์เขียวของสายพันธุ์ให้คงอยู่ตลอดไป

ต้นกำเนิด

โครงการนี้เกิดขึ้นจริงด้วยวิธีที่เหมาะสม — บนหลังผ้าเช็ดปาก ในขณะที่นักวิทยาศาสตร์บางคนครุ่นคิดถึงความลึกลับของชีวิต ในการอภิปรายของพวกเขา แฮร์ริส เลวิน, ยีน โรบินสัน, และ จอห์น เครส ถึงทางตันแล้ว การแสวงหาทางวิทยาศาสตร์ของพวกเขาแตกต่างออกไป - เลวินศึกษาวิวัฒนาการของจีโนม โดยโรบินสันเป็นต้นกำเนิดของพฤติกรรมทางสังคม แมลง และ Kress วิวัฒนาการร่วมกันของพืชและนก แต่พวกเขาต่างเห็นพ้องต้องกันว่าพวกเขาต้องการข้อมูลมากกว่านี้เพื่อถอดรหัสพวกมัน รหัสเฉพาะ

ศาสตราจารย์ Harris Lewin จากแผนกวิวัฒนาการและนิเวศวิทยาที่ UC Davisยูซี เดวิส

“มีคำถามหลายร้อยข้อที่เราจำเป็นต้องถามเพื่อทราบความลับของชีวิตบนโลกนี้” Lewin ศาสตราจารย์แห่งมหาวิทยาลัยแคลิฟอร์เนีย เดวิส กล่าวกับ Digital Trends

ในฐานะนักจีโนมิกส์ ข้อมูลจำนวนมากที่พวกเขาต้องการนั้นถูกบรรจุอยู่ใน DNA ดังนั้น Lewin จึงเขียนข้อความบางส่วน การคำนวณด้านหลังผ้าเช็ดปากเพื่อดูว่าต้องใช้อะไรบ้างในการกวาดล้างทั้งหมด โดยจัดลำดับจีโนมของทั้งหมด ชีวิตพืชและสัตว์ เขากล่าวว่ามันดูเหมือนเป็นไปได้ ดังนั้นพวกเขาจึงเริ่มคำนึงถึงผลที่ตามมาจากการมีแผนที่จีโนมของสิ่งมีชีวิตบนโลกที่กว้างขวางเช่นนี้

“เราตระหนักว่าสิ่งที่เรามีจะเป็นโครงสร้างพื้นฐานสำหรับชีววิทยาใหม่” เขากล่าว “เป็นวิทยาศาสตร์ โครงสร้างสำหรับการทำความเข้าใจอย่างแท้จริงว่าชีวิตวิวัฒนาการมาบนโลกนี้อย่างไร และแน่นอนว่าคุณจะได้อะไรจากสิ่งนี้ ความรู้."

ต่อมา นักวิจัยได้พัฒนาไทม์ไลน์และทำการคำนวณอย่างเป็นทางการอีกสองสามอย่าง โดยจัดทำแผน 10 ปีด้วยค่าใช้จ่ายประมาณ 4.7 พันล้านดอลลาร์

เหตุผล

โครงการ Earth BioGenome ขับเคลื่อนด้วยเป้าหมายหลักสองประการ ประการแรก ทรัพยากรดังกล่าวจะทำให้นักจีโนมิกส์สามารถเข้าถึงคู่มือการใช้งานของชีวิตได้อย่างที่ไม่เคยมีมาก่อน หากคุณคิดว่ายีนเป็นส่วนผสมและสิ่งมีชีวิตเป็นอาหาร จีโนมก็เหมือนกับสูตรอาหารในตำราอาหารเชิงวิวัฒนาการ การอ่านจีโนมอาจไม่ได้บอกคุณอย่างชัดเจนว่าทำไมสิ่งมีชีวิตถึงเป็นเช่นนี้ แต่มันช่วยให้คุณมีกรอบที่ชัดเจนในการศึกษาว่ามันเกิดขึ้นได้อย่างไร

แสดงข้อมูลการพัฒนาเชิงวิวัฒนาการของ Archaea (สีแดง), แบคทีเรีย (สีม่วง), เชื้อรา (สีส้ม), Plantae (สีน้ำเงิน), Protista (สีน้ำตาล) และ Animalia (สีเขียว) สถานะปัจจุบันของข้อมูลจีโนมจาก GenBank ของ NCBI จะแสดงอยู่ในวงกลมด้านในด้วย จีโนมที่สมบูรณ์มีสีแดง ระดับโครโมโซมเป็นสีน้ำเงิน โครงเป็นสีเทาเข้ม และ contigs มีแสง สีเทา.

“ชีวิตจัดระเบียบอย่างไร?” Lewin กล่าวโดยเริ่มแสดงรายการความลึกลับของวิวัฒนาการ “ความสัมพันธ์ระหว่างสิ่งมีชีวิตบนโลกคืออะไร? ยังไม่ชัดเจนว่าอนุกรมวิธานแบบดั้งเดิมทำอย่างไร … แต่โดยการเปรียบเทียบลำดับดีเอ็นเอกับแต่ละลำดับ อื่นๆ คุณสามารถเข้าใจความสัมพันธ์ และในเวลา ค้นหาสิ่งต่างๆ เช่น บรรพบุรุษอยู่ที่ไหน มาบรรจบกัน”

จุดมุ่งหมายอีกประการหนึ่งของโครงการนี้คือการทำแผนที่ DNA เพื่อประโยชน์ในการอนุรักษ์และการอนุรักษ์

“สำหรับหลายสายพันธุ์ในโลก มีเพียงคนเดียวเท่านั้นที่สามารถระบุสายพันธุ์นั้นได้”

“เมื่อคุณทราบข้อมูลทางพันธุกรรมนี้แล้ว คุณก็สามารถออกแบบโปรแกรมที่จะช่วยให้นักชีววิทยาด้านการอนุรักษ์สามารถพัฒนาแผนการอนุรักษ์และการอนุรักษ์ตามข้อมูลนั้นได้” เลวินกล่าว นั่นอาจฟังดูง่าย แต่จะมีแผนการที่กำหนดเองสำหรับแต่ละสายพันธุ์ที่เป็นปัญหา

ในช่วงแรกของโครงการ นักวิจัยจะพยายามจัดลำดับประมาณ 9,300 สปีชีส์ Lewin กล่าว อย่างน้อยหนึ่งสปีชีส์จากแต่ละตระกูลยูคาริโอต จากการคาดการณ์ของ Lewin มูลค่า 500 ล้านดอลลาร์ที่พวกเขาจะต้องจัดหาเงินทุนระยะที่ 1 ทีมงานสามารถระดมทุนได้ 100 ล้านดอลลาร์

พวกเขาจะขยายเครือข่ายในระยะต่อๆ ไป โดยมีเป้าหมายที่จะรวมสัตว์ 23,000 สายพันธุ์ที่อยู่ในรายการใกล้สูญพันธุ์โดย สหภาพนานาชาติเพื่อการอนุรักษ์ธรรมชาติ และในที่สุด พวกเขาหวังว่าจะจัดลำดับสิ่งที่ทราบทั้งหมด ชีวิต.

การทำเช่นนี้ด้วยตัวเองคงเป็นไปไม่ได้ ดังนั้น Lewin และเพื่อนร่วมงานจึงขอความช่วยเหลือ นักวิจัย สถาบัน และแม้แต่ทั้งประเทศได้แสดงความสนใจที่จะมีส่วนร่วมในโครงการ Earth BioGenome โดยรับภาระงานบางส่วนและช่วยเหลือในการเรียกเก็บเงิน

ห้องปฏิบัติการชีวสารสนเทศศาสตร์และจีโนมิกส์ที่ Laboratório Nacional de Bioinformática เป็นหนึ่งในองค์กรของบราซิลที่ได้รับเชิญให้เข้าร่วมใน EBGPแอสคอม / MCTIC

“ประเทศต่างๆ ทั่วโลกต้องการมีส่วนร่วมในวิธีที่มีความหมาย” เลวินกล่าว “ไม่ใช่แค่การจัดหาตัวอย่างให้กับโครงการเท่านั้น แต่ยังรวมถึง นอกจากนี้...การพัฒนาขีดความสามารถภายในและโครงสร้างพื้นฐานของตนเองสำหรับการจัดลำดับ การตีความ และสารสนเทศ” เขาชี้ไปที่ บราซิล ซึ่งต้องขอบคุณลุ่มน้ำอเมซอน คิดเป็นประมาณร้อยละ 10 ของความหลากหลายทางชีวภาพทั่วโลก ในฐานะประเทศที่กระตือรือร้นที่จะ มีส่วนเกี่ยวข้อง.

ความท้าทาย

โครงการนี้มีคำถามสองสามข้อไม่น้อยคือ เป็นไปได้และคุ้มค่าหรือไม่?

“สิ่งนี้ทำให้ฉันรู้สึกว่าอยู่ห่างไกลจากความท้าทายที่สำคัญ”

มีการค้นพบประมาณ 1.5 ล้านสายพันธุ์ แต่ผู้เชี่ยวชาญคิดว่านั่นเป็นเพียงสิบเปอร์เซ็นต์ของจำนวนพืชและสัตว์ทั้งหมดที่มีอยู่ จนถึงปัจจุบัน เราได้เรียงลำดับสปีชีส์ไว้ประมาณ 15,000 สปีชีส์

แต่เทคโนโลยีการหาลำดับได้ก้าวหน้าไปมากนับตั้งแต่โครงการจีโนมมนุษย์ ซึ่งเป็นโครงการริเริ่มมูลค่า 3 พันล้านดอลลาร์ที่ใช้เวลาดำเนินการ 13 ปี ไม่กี่ปีที่ผ่านมาบริษัทต่างๆ อวดอ้างว่าสามารถจัดลำดับจีโนมมนุษย์ทั้งหมดได้ในราคาต่ำกว่า 1,000 ดอลลาร์ ปีที่แล้วพวกเขาอ้างว่าสามารถทำได้ด้วยเงิน 100 ดอลลาร์ ดังนั้น Lewin จึงไม่กังวลเกี่ยวกับการจัดลำดับ – เขามุ่งเน้นไปที่การรับตัวอย่างตั้งแต่แรก

“การได้มาซึ่งตัวอย่างถือเป็นส่วนที่ยากที่สุด” เขากล่าว “การจัดลำดับไม่ใช่เรื่องยากที่สุด เรามีเทคโนโลยีในการทำเช่นนั้น เป็นการรับรอง การรวบรวม และตรวจสอบให้แน่ใจว่าสายพันธุ์บางชนิดนั้นถูกต้อง [นั่นจะเป็นความท้าทายที่ยิ่งใหญ่ที่สุด] สำหรับหลายสายพันธุ์ในโลก มีเพียงคนเดียวเท่านั้นที่สามารถระบุสายพันธุ์นั้นได้ มีผู้เชี่ยวชาญเพียงไม่กี่คนในโลกที่สามารถทำงานประเภทนี้ได้”

ภาพรวมโครงการและลำดับเวลาสำหรับโครงการ Earth BioGenome ในระยะเวลาสิบปีอีบีจีพี

ไม่ใช่ทุกคนที่คิดว่าโครงการนี้คุ้มค่าในการอนุรักษ์สายพันธุ์ ในสถานที่อย่างบราซิลอเมซอนที่พ่ายแพ้ ป่าฝนหลายพันตารางไมล์ต่อปี และอันไหน รัฐบาลดูเหมือนไม่เด็ดขาดในความมุ่งมั่นในการปกป้องการรณรงค์เพื่อจัดลำดับชนิดพันธุ์อาจขาดประเด็นไป

“คำถามหลักเกี่ยวกับสถานที่อย่างอเมซอนคือสิ่งที่เราสามารถทำได้เพื่อป้องกันไม่ให้ควันลุกลามในอีกสามสิบหรือสี่สิบปีข้างหน้า” สจวร์ต พิมนักนิเวศวิทยาเชิงอนุรักษ์และผู้เชี่ยวชาญด้านการศึกษาการสูญพันธุ์กล่าว “ถ้ามันลุกลามไปในควัน ไม่ว่าเราจะรู้จักจีโนมหรือไม่ก็ตาม นั่นจะไม่มีประโยชน์อะไรสำหรับเราเลย”

“ความรู้ใดๆ ที่ได้รับจากโครงการนี้หรือผลประโยชน์ที่ได้รับสามารถคืนได้หรือสามารถแบ่งปันผลประโยชน์บางส่วนได้…”

Pimm ยอมรับว่าเขา "ไม่ตื่นเต้นกับจีโนม" แต่กล่าวว่า "นี่ทำให้ฉันรู้สึกว่าอยู่ห่างไกลจากความท้าทายที่สำคัญ … ฉันไม่คิดว่านี่เป็น โครงการที่มีประโยชน์มากเมื่อคำนึงถึงความท้าทายด้านความหลากหลายทางชีวภาพที่เกี่ยวข้องกับการปกป้องป่าอเมซอนและการปกป้องความหลากหลายทางชีวภาพโดยรอบ โลก."

ไปสู่จุดจบอย่างไร

หากละเว้นการอนุรักษ์สายพันธุ์ โครงการ Earth BioGenome อาจใช้เวลาไม่ถึงหนึ่งทศวรรษจึงจะเริ่มได้รับผลตอบแทนในรูปแบบอื่น ในความร่วมมือครั้งล่าสุด โครงการได้เข้าร่วมกับ รหัสธนาคารโลกซึ่งเป็นแพลตฟอร์มดิจิทัลที่บันทึกและลงทะเบียนข้อมูลทางชีวภาพบนบล็อกเชนสาธารณะ โดยการสร้าง “ทรัพย์สินทางชีวภาพ” ของประเทศ รวมถึงรหัสพันธุกรรม ให้เปิดและได้รับการปกป้องจาก การสำรวจทางชีวภาพความร่วมมือนี้หวังที่จะช่วยให้นักสร้างสรรค์พัฒนายาและเทคโนโลยีที่ได้แรงบันดาลใจจากชีวภาพ ซึ่งสามารถกำหนดอนาคตของเราได้ แนวคิดอันสูงส่งขององค์กรบางส่วน ได้แก่ การใช้มดเพื่อควบคุมรถยนต์ไร้คนขับ และกบพิษเพื่อพัฒนายาต้านจุลชีพ

วิธีที่โครงการ Earth BioGenome และ Earth Bank of Codes จะทำงานร่วมกันเพื่อช่วยแบ่งปันการค้นพบ ข้อมูล และตัวอย่างกับองค์กรที่เข้าร่วมรหัสธนาคารโลก

“วัตถุประสงค์ [กับความร่วมมือครั้งนี้] คือเพื่อให้แน่ใจว่ามีการแบ่งปันผลประโยชน์จากการประดิษฐ์ นวัตกรรม และเทคโนโลยีใหม่ ๆ พัฒนาขึ้นอันเป็นผลมาจากการจัดลำดับความหลากหลายทางชีวภาพโดยที่ความหลากหลายทางชีวภาพมีแหล่งที่มาจากประเทศใดประเทศหนึ่งโดยเฉพาะ” เลวิน พูดว่า. “ความรู้ใดๆ ที่ได้รับจากโครงการนี้หรือผลประโยชน์ที่ได้รับสามารถคืนได้ หรือสามารถแบ่งปันผลประโยชน์บางส่วนกับประเทศเหล่านั้นได้”

ความร่วมมือดังกล่าวสามารถกระตุ้นโมเดลทางเศรษฐกิจใหม่สำหรับสถานที่ต่างๆ เช่น ลุ่มน้ำอเมซอน ซึ่ง เศรษฐกิจชีวภาพอาจตั้งอยู่บนพื้นฐานของแรงบันดาลใจจากสิ่งมีชีวิตทางชีวภาพมากกว่าการใช้ประโยชน์จากธรรมชาติ ทรัพยากร.

แต่ก่อนอื่นพวกเขาจะต้องเริ่มเรียงลำดับก่อน เหลือเพียงไม่กี่ล้านสายพันธุ์ที่จะไป

คำแนะนำของบรรณาธิการ

  • นักวิทยาศาสตร์ต้องการคลุมโลกด้วยเซ็นเซอร์ อาวุธลับของพวกเขาเหรอ? ผีเสื้อกลางคืน

หมวดหมู่

ล่าสุด

The Sims 4: Growing Together นำพลวัตของครอบครัวของเกมกลับมาใช้ใหม่

The Sims 4: Growing Together นำพลวัตของครอบครัวของเกมกลับมาใช้ใหม่

เดอะซิมส์ 4ส่วนขยายใหม่ล่าสุดของ เติบโตไปด้วยกั...

ทีมหญิงล้วนทีมแรกของ FaZe Clan พร้อมแล้วที่จะเป็นที่จับตามอง

ทีมหญิงล้วนทีมแรกของ FaZe Clan พร้อมแล้วที่จะเป็นที่จับตามอง

ในช่วงต้นเดือนมีนาคม 2023 FaZe Clan องค์กรอีสปอ...

ผู้เชี่ยวชาญ Overwatch ให้ความสำคัญกับการเปลี่ยนแปลงขนาดทีมของภาคต่อ

ผู้เชี่ยวชาญ Overwatch ให้ความสำคัญกับการเปลี่ยนแปลงขนาดทีมของภาคต่อ

โอเวอร์วอตช์ ได้เห็นการเปลี่ยนแปลงมากมายนับตั้ง...