Foldit gebruikt burgerwetenschappers om het coronavirus te bestrijden

In 2016, gamers hielpen bij het vinden van de structuur van een eiwit dat zou kunnen bijdragen aan de vorming van tandplak, wat een belangrijk gebied is van het onderzoek naar de ziekte van Alzheimer. Nu, de makers van het spel, Vouw hethopen dat burgerwetenschappers hun talenten zullen inzetten voor COVID-19, het nieuwe coronavirus. “We zijn geïnteresseerd in het ontwerpen van een antiviraal medicijn dat direct kan worden gebruikt om de infectie door het coronavirus te vertragen of te stoppen”, zegt Dr. Brian Koepnick, wetenschappelijk onderzoeker bij de Instituut voor Eiwitontwerp (IPD), vertelde Digital Trends.

Het nieuwe puzzelspel is gericht op het bouwen van een eiwit dat kan voorkomen dat het virus menselijke cellen infecteert. Onderzoekers hebben heb de structuur al gevonden van het coronavirus-spike-eiwit, dat het virus gebruikt om zich te binden aan menselijke celreceptoren.

Aanbevolen video's

“Zodra we de structuur van het coronavirus kennen, is dat ons doel”, aldus Koepnick. "Dus we kunnen beginnen met het ontwerpen van moleculen tegen dat doelwit." Met Foldit ontwerpen spelers eiwitten die aan het coronavirus blijven plakken, waardoor het vermogen om meer menselijke cellen te infecteren wordt geblokkeerd.

Verwant

  • Crowdfunding in tijden van corona
  • Maakt u zich zorgen over rekeningen tijdens de coronapandemie? Deze A.I. advocaat kan helpen
  • De Franse politie heeft onlangs luidsprekerdrones gebruikt om de vergrendeling van het coronavirus af te dwingen

Om te spelen kan iedereen de nieuwe coronaviruspuzzel downloaden en uitvoeren. De site heeft gehad enkele serverproblemen terwijl mensen zich haastten om deel te nemen, maar ze zijn weer actief. In het spel krijg je een 3D-structuur. Zelfs als je niet veel weet over biologie, hoef je alleen maar te begrijpen dat je eiwitten vouwt. “Eén manier om er in een totaal abstracte term over na te denken is: het is een beetje alsof je een slot krijgt aangeboden en wordt gevraagd de sleutel te bedenken”, zegt Koepnick.

Foldit-puzzelspel voor Conronavirus

Je zult je concentreren op het ontwerpen van een eiwit dat zich hecht aan de ‘zijketens’ van de bindingsplaats. Dit is waar het spike-eiwit het menselijke receptoreiwit ontmoet. Je eiwit moet niet alleen bij de zijketen passen, je moet ook de secundaire structuur en kern zo ontwerpen dat ze correct worden opgevouwen. “Er zijn veel manieren waarop die sleutel kan worden vormgegeven, dus we vertrouwen echt op de creativiteit van deze spelers, die niet veel over de wetenschap hoeven te weten”, zei Koepnick.

Foldit debuteerde in 2008, bij de oprichting van de Universiteit van Washington Centrum voor Gamewetenschap. Het behaalde een vroege overwinning in 2011, toen spelers hielpen ontdekken de moleculaire structuur van het retrovirale proteasen-enzym M-PMV, dat een belangrijke rol speelt bij de ontwikkeling van een virus dat lijkt op HIV. Het kostte de deelnemers slechts tien dagen om een ​​puzzel op te lossen die wetenschappers al tien jaar ontging.

Voor beginners is er een tutorial waarin je een bestaand eiwit aanpast aan het coronavirus. In de geavanceerde versie beginnen spelers hun eigen eiwitten te ontwerpen. Om te weten of het goed met je gaat, hoef je alleen maar op je score te letten. Onderzoekers van het IPD kijken mee.. Ze zouden mogelijk een vaccin kunnen gaan ontwikkelen op basis van een eiwit dat in het spel is ontworpen. Ze zullen de nieuwe eiwitten mengen met het coronavirus om te zien of ze daadwerkelijk binden. De eiwitten die dat wel doen, kunnen worden ontwikkeld tot antivirale medicijnen die vervolgens moeten worden getest op dieren en mensen. Met andere woorden: het is nog ver weg.

“Dit is de allereerste stap in de ontwikkeling van geneesmiddelen”, aldus Koepnick.

Aanbevelingen van de redactie

  • Nieuw coronavirusdashboard biedt verbazingwekkend gedetailleerde gegevens per provincie
  • AI kan helpen bij het opsporen van veelbetekenende tekenen van coronavirus op röntgenfoto’s van de longen
  • Diepe ruimtemissies getroffen door het coronavirus, zegt European Space Agency
  • De app voor het volgen van het coronavirus van MIT zou een gamechanger kunnen zijn – als deze viraal gaat
  • Deze app kan u vertellen of u iemand bent tegengekomen die het coronavirus heeft

Upgrade uw levensstijlMet Digital Trends kunnen lezers de snelle technische wereld in de gaten houden met het laatste nieuws, leuke productrecensies, inzichtelijke redactionele artikelen en unieke sneak peeks.