細菌のための終末貯蔵庫を構築する計画の内部

マイクロバイオームの保管庫
Chris DeGraw/デジタル トレンド グラフィック

ノルウェーのスバールバル諸島には、氷の洞窟、犬ぞり、さらにはホッキョクグマの生息地ですが、おそらく最も有名なのは、世界種子貯蔵庫です。 巨大な種子銀行 凍った山の斜面に直接建てられました。 その考えは、世界が他の遺伝子バンクを一掃するような壊滅的な大惨事に見舞われた場合、スヴァールバル諸島の金庫が消滅するというものである。 それはバックアップとして機能し、人類が主食作物や薬用植物などの重要な植物種を世界に再植生できるようにするでしょう。 ハーブ。

コンテンツ

  • あなたの微生物叢とあなた
  • 緊急の場合に
  • 倫理的問題

しかし、バックアップを保持しておきたい自然界の一部は種子だけではありません。 最近、科学者たちは、重要な微生物のための同様の終末保管庫、いわば細菌のためのノアの箱舟を構築することの利点について検討し始めています。

マイクロバイオーム保管庫

ラトガース大学の微生物学者、マリア・グロリア・ドミンゲス・ベロ博士は、種子の保管について聞いたとき、類似点が頭に浮かんだ、とデジタル・トレンドに語った。 「それはとても明白だったので、マイクロバイオームのためにそのようなことをするというアイデアに非常に興味を持ちました」と彼女は言いました。

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あなたの微生物叢とあなた

微生物叢とは、皮膚や胃腸管などの特定の環境で見られる、細菌、ウイルス、真菌を含むすべての微生物です。 マイクロバイオームとは、それらの微生物とその遺伝子を指します。 腸内でのこれらの微生物の混合には多くの要因が影響します。 世襲的な そして 環境 コンポーネント。 微生物叢が人間の健康にどのような影響を与えるかに関する研究 まだ比較的新しい、しかし、それらは免疫系、酵素合成、および複雑な炭水化物の消化において役割を果たしていると考えられています。

グロリア ドミンゲス ベロとマーティン J. 「Microbiota Vault」イニシアチブに関するブレイザー

一部の研究者は、工業地帯の人々の微生物叢がどのように変化するかを研究しています。 それらとは異なります 田舎や遠隔地では。 食事、汚染、投薬、衛生設備、その他の都市環境の指標が微生物のこうした変化を示す可能性があります。 研究によると、 そのような違いが存在しますこれらの変化が糖尿病や心臓病などの慢性疾患の増加を引き起こしているかどうかはまだ完全には明らかではありません。

しかし、ドミンゲスベロ氏は、微生物叢の研究が成熟するにつれて、その実践者が失われてしまうのではないかと懸念している。 より伝統的で多様なライフスタイルを持つ先住民族の貴重なデータを活用する 微生物叢。 「もっとよくわかる頃には、今保存しなければ、もう手に入らないでしょう」と彼女は言う。

緊急の場合に

ドミンゲスベロさんは母国のベネズエラとプエルトリコの両方で働いた経験があり、政情不安や気候変動の脅威がサンプル収集にもたらす危険性を身を持って知っている。 2012 年に彼女はニューヨーク大学に移りましたが、わずか 1 か月後にハリケーン サンディが直撃しました。 彼女と彼女のチームはサンプルを救出するためにヘッドランプを付けて研究室に入らなければなりませんでした。 「私は、私たちの個々のコレクションがどれほど脆弱であるかを肌で感じました」と彼女は言いました。

スバールバル諸島プロジェクトに関与する研究者と連絡を取った後、ドミンゲスベロ氏は、微生物叢の保管庫を作成する可能性を検討するために、自分の専門分野の科学者を集め始めました。 今年の6月中旬、 実現可能性調査 EvalueScience と Advocacy という 2 つの独立機関からは、この提案は「重要性が高く、 潜在的。" ドミンゲスベロ氏は、研究の完了によってプロジェクトが妊娠期から新生児に移行することになると考えている 段階。 次のステップは、アウトリーチと慈善活動に特化したいくつかの委員会を設立することです。 保管庫の場所、資金、技術的問題を最終決定する。 教育と国際関係を改善する。 そして他の地域。

北極世界データアーカイブグローバルシードボールト
グローバル作物多様性トラスト/Flickr

世界中にはすでに多数の微生物コレクションが存在します。 アメリカン・ガット・プロジェクト, アジア微生物叢バンク、 そしてその 100万人の人類マイクロバイオームプロジェクト. 大きなステップの1つは、そのような銀行の管理者を説得して、バックアップ保管用のサンプルを引き渡すことだ。 もう 1 つの目標は、より多くの地域コレクション、特に先住民グループのコレクションの作成を奨励​​することです。

「ローカル コレクションはライブ コレクションであるため、ローカル コレクションは非常に重要です」と Dominguez-Bello 氏は言います。 これらのサンプルは研究や共同作業に使用でき、追加の資料は保管庫での長期保管のために準備されています。 ある日、保管庫には数十万のサンプルが保管される可能性がありますが、パイロット プログラムは数千から開始されます。

保管庫の参加者は、ペルー、ボリビア、インドネシアを含むいくつかの国と連絡を取り始めています。 「そして、私たちがそれを計画している方法は、教育を通じてです」とドミンゲスベロ氏は語った。

「これは微生物学を超えたものです」

この計画は、さまざまな国の大学と提携して、地元の科学者にマイクロバイオーム、そのようなコレクションが必要な理由、サンプルの収集と保存方法について教えることです。 「これは単なる微生物学を超えたものです」とドミンゲスベロ氏は言う。 「これも人類学であり倫理学です。」 海外の大学は現地の専門家とつながることで、 法律や許可を理解しやすくなり、先住民とのコミュニケーションが容易になる可能性がある グループ。 最初の10日間のコースはペルーで予定されていたが、それは新型コロナウイルス感染症が流行する前のことだった。

地元の医療チームや人類学者は、サンプルを冷却するのに十分な電力の信頼性があるかどうかなど、その地域特有の課題にも精通しているでしょう。 長期保存には、生きたサンプルとは異なる課題があります。 実現可能性調査では、そのような保管のための微生物の準備について研究者が理解していないことが多くあることが認められました。 いくつかの方法では、特定の生物を保存しながら他の生物を死滅させることができます。

ボールトの 2 つの可能な方法は、液体窒素を使用した凍結保存と、凍結乾燥またはフリーズドライです。 ドミンゲスベロ氏は、液体窒素がゴールドスタンダードである一方で、十分に寒い場所に保管されていれば、凍結乾燥されたサンプルには電気は必要ないと述べた。 微生物叢保管庫の主催者は、スイスかノルウェーのいずれか、あるいは両方の場所を検討している。 実現可能性研究の著者らは、凍結乾燥サンプルがスバールバル諸島の種子貯蔵庫に保管される可能性があると示唆した。

倫理的問題

種子が詰まった保管庫とは異なり、人間のサンプルを収集して保管する場合には、倫理的およびプライバシー上の懸念が伴います。 コレクションが保管および調達される両国の法律は異なる場合があります。 たとえば、スイスやノルウェーを含むいくつかの国は、 名古屋議定書、遺伝子研究から得られる利益を公平に共有しようとする国際協定。 微生物叢のサンプルがこの協定に該当するかどうかはまだ議論中です。

いずれにせよ、ドミンゲスベロ氏は、これらの微生物叢サンプルから利益を得ようとするあらゆる機関がそう信じている。 たとえば、新しいプロバイオティクスを作成することによって、関連するものを寄付したコミュニティに対する責任があります。 サンプル。 「細菌の発生源となった人々には倫理的義務があります」と彼女は言う。 たとえば、研究者は、地域のニーズに基づいて、学校の再建を支援したり、医療機器を提供したりする場合があります。 「彼らのコミュニティ全体の幸福のために、何かをしなければなりません」と彼女は言いました。

また、保管庫は、個人だけでなく、場合によってはコミュニティ全体のプライバシーを維持しながら、データをオープンに共有するバランスを取る必要もあります。 人口が十分に小さい場合は、人の年齢を入力するだけでも個人を特定できる可能性があります。

同時に、この金庫はネットワークを促進し、研究者間のコラボレーションを促進することを目的としています。 「これは私たちの学生だけでなく、米国、フランス、スイス、スウェーデン、ノルウェーなどの将来の世代の科学者を教育することにも非常に密接に関係していると思います。 ドミンゲスベロ氏は、「ポルトガルだけでなく、研究室や設備へのアクセスがほとんどない国でも同様だ」と述べ、「我々は科学コミュニティを拡大して、 彼ら。 マイクロバイオームはそれを行うのに最適な場だと思います。」