Управљање подацима система датотека има кључне недостатке у поређењу са системима за управљање базама података
Управљање подацима система датотека (или база података са равним датотекама) служило је као једини метод складиштења и преузимања датотека пре појаве система за управљање базама података (као што су релационе базе података). Иако задржавају одређену употребу, базе података са равним датотекама пате од лоше приступачности, редундантности података, недостатка стандардног приступа датотекама и немогућности организовања података.
Редунданца података
Пошто се базе података равних датотека ослањају на датотеке које садрже записе као текст без икаквих структурних података, оне не могу повезати податке из једне датотеке у другу. На пример, ако једна датотека садржи запис адресе господина Џонсона, друга датотека која користи информације о адреси господина Џонсона мора поново да креира те податке. Друга датотека мора дуплирати податке. То значи да подаци о адреси господина Џонсона постоје у две датотеке одједном. У великим размерама, ово доводи до редундантности података која може брзо заузети простор у бази података и показати се трошковно неефикасном.
Видео дана
Ограничени кориснички приступ
Системи равних датотека обично не подржавају приступ за више корисника. То значи да више корисника на различитим радним станицама не може истовремено приступити истим подацима, ограничавајући приступ важним подацима ако више корисника тражи исте податке у исто време
Недостатак стандарда за складиштење и приступ
Пошто се систем равних датотека ослања на датотеке за складиштење података, он се нужно ослања на систем датотека који дефинише како се те датотеке чувају и читају. Ово повезује податке са системом који их складишти, а сваки софтвер који се користи за приступ подацима мора бити у складу са системом складиштења. Сходно томе, све промене у бази података захтевају промене у целом софтверу који јој приступа.
Недостатак трансакција
Захтевање података из базе података са равним датотекама једноставно преузима податке из једне датотеке. Захтевање и преузимање података из различитих датотека у исто време (назива се „трансакција“) је немогуће. То значи да сложени захтеви који чине преузимање података тачним и ефикасним једноставно не постоје.