En 2016, les joueurs ont aidé à trouver la structure d'une protéine cela pourrait favoriser la formation de plaques, qui constitue un domaine important de la recherche sur la maladie d’Alzheimer. Maintenant, les créateurs du jeu, Plie le, espèrent que les scientifiques citoyens consacreront leurs talents au COVID-19, le nouveau coronavirus. "Nous souhaitons concevoir un médicament antiviral qui pourrait être utilisé directement pour ralentir ou arrêter l'infection par le coronavirus", a déclaré le Dr Brian Koepnick, chercheur scientifique au Institut pour la conception de protéines (IPD), a déclaré à Digital Trends.
Le nouveau jeu de réflexion vise à créer une protéine capable d’empêcher le virus d’infecter les cellules humaines. Les chercheurs ont j'ai déjà trouvé la structure de la protéine Spike du coronavirus, que le virus utilise pour se lier aux récepteurs des cellules humaines.
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"Une fois que nous connaissons la structure du coronavirus, c'est notre cible", a déclaré Koepnick. "Nous pouvons donc commencer à concevoir des molécules contre cette cible." Avec Foldit, les joueurs conçoivent des protéines qui adhèrent au coronavirus, bloquant ainsi sa capacité à infecter davantage de cellules humaines.
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Pour jouer, n’importe qui peut télécharger et exécuter le nouveau puzzle du coronavirus. Le site a eu quelques problèmes de serveur alors que les gens se sont précipités pour participer, mais ils sont à nouveau opérationnels. Dans le jeu, vous obtiendrez une structure 3D. Même si vous ne connaissez pas grand-chose en biologie, tout ce que vous devez comprendre, c’est que vous repliez des protéines. "Une façon d'y penser de manière totalement abstraite est de dire que c'est un peu comme si on lui présentait une serrure et qu'on lui demandait de trouver la clé", a déclaré Koepnick.
Vous vous concentrerez sur la conception d’une protéine qui se fixe aux « chaînes latérales » du site de liaison. C’est là que la protéine Spike rencontre la protéine réceptrice humaine. Non seulement votre protéine devra s’adapter à la sidechain, mais vous devrez également concevoir sa structure secondaire et son noyau afin qu’ils se replient correctement. "Il existe de nombreuses façons de façonner cette clé, nous comptons donc vraiment sur la créativité de ces joueurs, qui n'ont pas besoin de beaucoup de connaissances scientifiques", a déclaré Koepnick.
Foldit a fait ses débuts en 2008, lors de la création du Centre pour la science du jeu. Elle a remporté une victoire précoce en 2011, lorsque les joueurs ont aidé à découvrir la structure moléculaire de l'enzyme protéase rétrovirale M-PMV, qui joue un rôle majeur dans le développement d'un virus similaire au VIH. Il n’a fallu que 10 jours aux participants pour résoudre une énigme qui échappait aux scientifiques depuis une décennie.
Pour les débutants, il existe un tutoriel dans lequel vous adaptez une protéine existante au coronavirus. Dans la version avancée, les joueurs commencent à concevoir leurs propres protéines. Pour savoir si vous vous en sortez bien, il vous suffit de faire attention à votre score. Les chercheurs de l’IPD seront également présents. Ils pourraient éventuellement commencer à développer un vaccin basé sur une protéine conçue dans le jeu. Ils mélangeront les nouvelles protéines avec le coronavirus pour voir si elles se lient réellement et celles qui le font pourraient être transformées en médicaments antiviraux qui devraient ensuite être testés sur des animaux et des humains. En d’autres termes, c’est encore loin.
"Il s'agit de la toute première étape du développement d'un médicament", a déclaré Koepnick.
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