Poškozené soubory mohou být způsobeny řadou systémových chyb. Za normálních okolností, když dojde k poškození souboru, nelze k němu získat přístup nebo dojde ke ztrátě některých dat v souboru. V některých případech lze data z poškozeného souboru obnovit, jako například v některých aplikacích sady Microsoft Office, které mají „režim obnovy“ pro automaticky uložená data.
Špatné sektory
Sektory jsou oddíly pevného disku. Když se uživatel pokusí uložit soubor, počítač vyhledá sektor na pevném disku pro uložení dat. Pokud počítač uloží soubor do „chybného sektoru“, soubor se pravděpodobně poškodí nebo nebude přístupný. Chybné sektory mohou být způsobeny fyzickým poškozením (tj. ztráta magnetismu pevného disku a tím i schopnosti ukládat data) nebo špatnými kontrolami parity na disku. Počítač neví, které sektory jsou špatné nebo nestabilní, takže uživatel musí prohledat pevné disky (jako je jednotka C), aby zkontroloval, zda na nich nejsou vadné sektory. To lze provést kliknutím pravým tlačítkem myši na jednotku z „Tento počítač“, výběrem „Vlastnosti“, „Nástroje“ a výběrem „Zkontrolovat nyní“ pod nadpisem „Kontrola chyb“.
Video dne
V počítačových systémech je „shluk“ nejmenší množství místa na disku potřebné k uložení souboru. Souborům jsou přidělovány jednotlivé clustery, které se mohou pohybovat od jednoho sektoru (512 bajtů) do 128 sektorů (64 kilobajtů). K překříženému souboru dochází, když jsou dva nebo více souborů přiděleny stejnému clusteru, což poškodí všechny soubory uložené ve stejném clusteru. Ztracené clustery mohou také způsobit poškození souborů; když je soubor odstraněn ze seznamu adresářů počítače, ale tabulka přidělení souborů (FAT) stále zobrazuje clustery přidělené tomuto souboru, clustery se „ztratí“ a data uložená do tohoto clusteru se zobrazí jako „křížově propojená“, i když byl výpis adresáře již smazán.
Infikované soubory a viry
Viry mohou mazat soubory, infikovat počítačový registr, měnit štítky svazků, označovat sektory jako špatné jednotku, označit clustery jako špatné ve FAT, vytvořit překřížené soubory nebo vytvořit nové oddíly na disku řídit. Virus může snadno změnit způsob ukládání a čtení souborů v počítači a způsobit poškození souborů, i když s pevným diskem neexistuje žádný problém. Viry mohou například označit sektory za špatné, pokud fungují normálně, a způsobit poškození nebo nedostupnost všech souborů pro uživatele v daném sektoru.
Selhání systému
Zhroucení systému může být způsobeno různými faktory v počítačovém systému. K logickým selháním (tj. úplnému vypnutí nebo „modré obrazovce smrti“ pro uživatele Windows) dochází, když programy používají konfliktní paměť nebo když je poškozen nový hardware. Programům je normálně přidělena paměť ze systému a nemohou sdílet část paměti; pokud jeden program přistupuje k přidělené paměti jiného programu, může dojít k selhání. Pokud programy využívající paměť jádra (důvěryhodné programy, jako je operační systém nebo ovladače hardwaru) přistupují k paměti jiného programu jádra, dojde k zhroucení/vypnutí systému. V obou případech, pokud se soubor ukládá, přistupuje nebo někdy otevírá, může dojít k poškození souboru v důsledku náhlého vypnutí.